Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKD2L1Q9P0L9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms