Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MIS18AQ9NYP9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIS18AQ9NYP9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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