Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT57Q9NWB7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms