Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO28Q9NVF7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms