Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DCAF13Q9NV06 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms