Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC4BQ9NT99 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms