Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF275Q9NSD4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF275Q9NSD4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms