Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TM7SF3Q9NS93 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TM7SF3Q9NS93 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms