Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBP3Q9NS15 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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