Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMPRSS4Q9NRS4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMPRSS4Q9NRS4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms