Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP4Q9NRJ4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP4Q9NRJ4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms