Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLE3Q9NRF9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms