Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC31BQ9NQW1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms