Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ASCL3Q9NQ33 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASCL3Q9NQ33 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms