Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FZD3Q9NPG1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FZD3Q9NPG1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms