Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC17Q9NP64 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC17Q9NP64 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms