Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00574Q9H8X3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms