Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SENP3Q9H4L4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SENP3Q9H4L4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms