Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6AQ9H2E6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6AQ9H2E6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms