Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMX4Q9H1E5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX4Q9H1E5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms