Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT23Q9C075 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT23Q9C075 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms