Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRIM55Q9BYV6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM55Q9BYV6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms