Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms