Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRIP1Q9BX63 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRIP1Q9BX63 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms