Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFHD1Q9BUP0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms