Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms