Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDF4Q9BRK5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDF4Q9BRK5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms