Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TXNDC17Q9BRA2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms