Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNS3Q9BQ31 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms