Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAT1Q99536 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms