Protein–RNA interactions for Protein: Q96SA4

SERINC2, Serine incorporator 2, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2Q96SA4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SERINC2Q96SA4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SERINC2Q96SA4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms