Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms