Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PHF12Q96QT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHF12Q96QT6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms