Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
OPALINQ96PE5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms