Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCMTD1Q96MG8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms