Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC7Q96M83 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC7Q96M83 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms