Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM227BQ96M60 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms