Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALPK3Q96L96 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALPK3Q96L96 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms