Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HIC2Q96JB3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIC2Q96JB3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms