Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COG3Q96JB2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms