Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CELF6Q96J87 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms