Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZDHHC12Q96GR4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZDHHC12Q96GR4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms