Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LTV1Q96GA3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LTV1Q96GA3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms