Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC51Q96ER9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms