Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RNF183Q96D59 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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RNF183Q96D59 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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RNF183Q96D59 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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RNF183Q96D59 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RNF183Q96D59 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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