Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFT1Q96AA3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms