Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRIM52Q96A61 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM52Q96A61 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms