Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC102AQ96A19 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC102AQ96A19 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms