Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPTSSAQ969W0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPTSSAQ969W0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms