Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF34Q969K3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms